La rizofiltrazione è la captazione, da parte delle piante, degli inquinanti presenti in forma disciolta nelle acqua sotterranee. Avviene nella zona radicale, tramite processi di adsorbimento, concentrazione o precipitazione dei contaminanti.

Serve per risanare acque di scarico urbane/industriali. La pianta deve produrre molta biomassa radicale e deve avere una crescita rapida. Sono poi le radici che agiscono sulla sostanza inquinante attraverso processi di precipitazione, assorbimento e adsorbimento. Anche in questo caso non si vuole la traslocazione alla parte aerea. In questo intervento si usano specie non idrofite e dunque bisogna ossigenare l’acqua da depurare. Alcuni esempi sono mais e girasole.